Respuesta objetiva y seria:
Dudo muchísimo que algún forista conozca los detalles de como opera el sistema de inmigración y extranjería de Peru.
Yo no se si las autoridades peruanas tienen sistemas automatizados, bases de datos unificadas, de todos los ingresos y egresos de personas, y los días que tienen dentro del país.
En caso de que lo tengan, tu nombre es el mismo en ambos pasaportes y ellos lo saben. No creo que puedas ocultar que son la misma persona con pasaportes diferentes.
Tampoco conozco cuanto tiempo hay que esperar para volver al país después que salgas del país la primera vez. Esa es la clave de todo.